本区地处亚非荒漠东部边缘，为西鄂尔多斯荒漠化草原和东阿拉善草原化荒漠的过渡地区，是古地中海孑遗植物四合木、半日花、绵刺、沙冬青、革包菊、蒙古扁桃、胡杨等集中分布的地方。区内现已查明高等植物335种，其中特有古老残遗种及其它濒危植物有72种，占全部植物种数21.79%，被列为国家重点保护的野生植物有7种。特别是四合木和半日花仅分布于保护区的小面积范围之内，具有极高的保护和科学研究价值。此外，保护区还保存着极高的保护和科学研究价值。此外，保护区还保存着极其珍贵的古地理环境，古生物化古十分丰富，山地地层剖面明显，是非常珍贵的天然史书。因此，该区的建立，不仅在生物多样性的就地保护方面具有极为重要的意义，而且对研究生物的起源、发展演变以及地质构造和古地理环境均有着深远的意义，同时，对于保护和改善我国荒漠地区的生活环境和探索荒漠地区可持续发展途径也具有重要的价值。