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据说两个宫供奉的都是同一个人:保生大帝吴夲。
吴夲(979~1036),字华基,号云冲,出身于福建龙海市白礁村的贫苦农民家庭,年轻时云游四方,拜师学医并选定青礁村作为其修道、炼丹、行医之处。吴夲不仅医术高明,且医德高尚,治病不分贵贱,不取报酬。宋明道二年(1033)漳州、泉州瘟疫流行,因吴夲义诊施药而得以存活者难以计数。民间还流传吴夲治愈宋仁宗母后的乳癌,被封为“妙道真人”而扬名四海的事迹。景祐三年(1036)五月初二,吴夲在文圃山采药不幸坠崖而死,时年58岁。
为了祭拜吴夲,建造了慈济宫于海沧,命名为青礁慈济宫。厦漳泉来朝拜的人员不计其数。后因祭拜的人员实在太多,经商讨,再在漳州建造了一个宫殿,命名为白礁慈济宫。